Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP9BO43861 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms