Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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