Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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GGTLC3B5MD39 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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GGTLC3B5MD39 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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GGTLC3B5MD39 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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GGTLC3B5MD39 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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GGTLC3B5MD39 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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GGTLC3B5MD39 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GGTLC3B5MD39 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GGTLC3B5MD39 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GGTLC3B5MD39 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GGTLC3B5MD39 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GGTLC3B5MD39 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GGTLC3B5MD39 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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