Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC182A6NF36 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC182A6NF36 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms