Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC4Q9Y296 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms