Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
HPS5Q9UPZ3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HPS5Q9UPZ3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms