Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms