Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMG20AQ9NP66 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMG20AQ9NP66 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms