Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms