Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM43Q9BTV4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms