Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPAP2Q8IXW5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms