Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms