Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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