Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAQ29983 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAQ29983 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms