Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NEDD8Q15843 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NEDD8Q15843 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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