Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCAPHQ15003 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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