Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB1Q14028 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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