Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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