Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms