Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms