Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGCXP38435 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms