Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC1P33527 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms