Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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CASQ1P31415 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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CASQ1P31415 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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CASQ1P31415 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASQ1P31415 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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