Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA3P25788 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms