Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP11P24347 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP11P24347 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP11P24347 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP11P24347 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms