Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC9A1P19634 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms