Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEBLO76041 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEBLO76041 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEBLO76041 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEBLO76041 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEBLO76041 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NEBLO76041 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms