Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBDO15205 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBDO15205 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UBDO15205 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBDO15205 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBDO15205 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms