Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC169A6NNP5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC169A6NNP5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms