Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAB39Q9Y376 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms