Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIT1Q9Y2X7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GIT1Q9Y2X7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIT1Q9Y2X7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIT1Q9Y2X7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIT1Q9Y2X7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIT1Q9Y2X7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIT1Q9Y2X7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIT1Q9Y2X7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GIT1Q9Y2X7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GIT1Q9Y2X7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIT1Q9Y2X7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms