Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms