Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2J2Q9GZM3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms