Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BCO2Q9BYV7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms