Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms