Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms