Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HINFPQ9BQA5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms