Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC41A2Q96JW4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms