Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TM4SF18Q96CE8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms