Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PYDC1Q8WXC3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms