Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC21AQ8NDW8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC21AQ8NDW8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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