Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIX1LQ8IVB5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms