Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms