Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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LINC00299Q6ZSB3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00299Q6ZSB3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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