Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN4Q5MJ08 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms