Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms