Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms