Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPTX1Q15818 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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