Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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TRIP10Q15642 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TRIP10Q15642 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TRIP10Q15642 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TRIP10Q15642 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms