Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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UBE2V1Q13404 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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UBE2V1Q13404 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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UBE2V1Q13404 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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UBE2V1Q13404 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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UBE2V1Q13404 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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UBE2V1Q13404 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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UBE2V1Q13404 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UBE2V1Q13404 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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